வரதராஜ பெருமாள் கோவில் காஞ்சிபுரத்தில் அமைந்துள்ள ஓர் மகத்தான ஆன்மிகத் தலமாகும். வரதராஜர், மகா விஷ்ணுவின் தனியான அவதாரம், மனம் தூய்மையடைந்து, பக்தர்களுக்கு ஆசீர்வாதம் வழங்கும் பெருமாளாக அறியப்படுகிறார். இந்த கோவில் கதையின் படி, பிரம்மா தம்முடைய மனைவி சரஸ்வதியை விட்டு விட்டு, மற்ற மனைவிகள் சாவித்திரி, காயத்ரி ஆகியோரை வைத்து ஒரு யாகத்தை செய்தார். இதனால் கோபமான சரஸ்வதி, வேகவதி என்ற ஆற்றை உருவாக்கி யாகத்தை அழிக்க வந்தாள்.
பிரம்மதேவன் மகா விஷ்ணுவான பெருமாளிடம் வேண்டி, அவர் வெள்ளப்பெருக்கு வந்த வழியில் சயனித்து படுத்திருந்ததால் ஆற்று நீர் தடைபட்டு, அந்த இடம் “வரதராஜர்” எனப் பெயர் பெற்றது. இதன் காரணமாக இந்த கோவில் பெருமாள் வரதராஜர் என அழைக்கப்படுகிறார்.
இந்த கோவிலில் அனந்த சரஸ்வதி மற்றும் பொற்றாமரை என்ற இரண்டு திருக்குளங்கள் உள்ளன. அனந்த சரஸ்வதி குளத்தில், 40 ஆண்டுக்கு ஒருமுறை அத்திவரதர் 10 அடி உயரம் கொண்ட அத்திமரத்தால் செய்யப்பட்ட சயன கோலத்தில் எழுந்தருளி, 48 நாட்கள் பக்தர்களுக்கு அருள்பாலிப்பார்.
மேலும், இந்த கோவில் முந்தைய காலங்களில், கவுதம முனிவரின் சீடர்களான தங்கப்பல்லி மற்றும் வெள்ளிப்பல்லிசிருங்கி பேரார்கள் பல்லி உருவாகி சாபம் பெற்றனர். பின்னர் அவர்களும் காஞ்சிபுரம் வரதராஜரிடம் வேதனை தீர்த்தனர். பெருமாள் பக்தர்களின் தோஷங்களையும் நீக்கி, ஆன்மிக முன்னேற்றத்தையும் வழங்குவார் எனக் கூறப்படுகின்றது.
